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Exploring Population Genetic Models With Recombination Using Efficient Forward-Time Simulations

机译:使用有效的前向时间仿真探索具有重组的种群遗传模型

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摘要

We present an exact forward-in-time algorithm that can efficiently simulate the evolution of a finite population under the Wright–Fisher model. We used simulations based on this algorithm to verify the accuracy of the ancestral recombination graph approximation by comparing it to the exact Wright–Fisher scenario. We find that the recombination graph is generally a very good approximation for models with complete outcrossing, whereas, for models with self-fertilization, the approximation becomes slightly inexact for some combinations of selfing and recombination parameters.
机译:我们提出了一种精确的实时算法,该算法可以有效地模拟Wright-Fisher模型下有限种群的演化。我们使用基于该算法的仿真,通过将其与精确的Wright–Fisher场景进行比较,来验证祖先重组图近似的准确性。我们发现重组图通常对于具有完全异交的模型是非常好的近似,而对于具有自受精的模型,对于自交和重组参数的某些组合,近似变得不精确。

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