山核桃EST-SSR引物的筛选及通用性分析

摘要

为了研究核桃EST序列的通用性以及山核桃的遗传多样性,从NCBI数据库的核桃EST序列中设计了20对引物,并从中筛选出6对,对24份山核桃以及27份核桃样品进行分析,共检测到46个位点,其中多态性位点41个.利用Popgen32软件对6组引物进行分析.结果表明,观察等位基因数(Na)平均为1.8696,有效等位基因数(Ne)平均为1.6234,基因多样性指数(H)平均为0.3447,Shannon信息指数(I)平均为0.5023.采用UPGMA法进行聚类分析,在相似系数为0.73时所有样品可明显区分为2个类群,说明由核桃EST筛选出的EST-SSR引物具有较好的通用性,可用于山核桃遗传分析、系统分类以及品种鉴定.