用gap基因和MALDI-TOF MS技术对临床常见凝固酶阴性葡萄球菌快速分子鉴定

摘要

目的 研究旨在通过对比gap基因和基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(matrix assisted laser desorption ionization time of flight mass spectrometry,MALDI-TOF MS)蛋白质质谱鉴定,建立对临床常见凝固酶阴性葡萄球菌(coagulase negative staphylococcus,CNS)的快速分子学鉴定.方法 用gap基因对临床常见CNS进行扩增和测序,获得序列在GenBank中进行比对,构建进化树进行同源分析,同时与MALDI-TOF MS蛋白质质谱鉴定比较.结果 Gap基因相似率为39％～98％,有足够序列差异区分CNS.进化树同源分析显示,CNS分类具有较高的可信度(大于77％);MALDI-TOF MS蛋白质质谱鉴定与gap基因鉴定符合率为100％.结论 MALDI-TOF MS蛋白质质谱鉴定可以用于CNS的快速、准确鉴定,比传统方法和分子方法具有优势.