玉米大斑病菌不同致病小种StBCK1基因生物信息学分析

摘要

[目的]为探索StBCK1基因功能的重要影响位点.[方法]通过CTAB法提取了玉米大斑病菌4个小种的基因组DNA,克隆StBCK1基因的关键序列,利用DNAMAN、MEGA和NetPhos2.0 Server比对了玉米大斑病菌不同小种间的遗传差异,并分析StBCK1的蛋白质磷酸化位点.[结果]StBCK1的蛋白质激酶结构域位于DNA序列的4155 ～ 5016位,肽链的1385 ～ 1672位;在DNA序列比对中发现3个SNP位点;1个位点导致氨基酸由亮氨酸转变为苯丙氨酸,2个位点导致丝氨酸突变为异亮氨酸和天冬酰胺突变为异亮氨酸;3个位点差异均与蛋白质磷酸化位点相关.[结论]3个位点的多态性影响了蛋白质结构与功能,进而影响了玉米大斑病菌的致病性差异.