基于党参有效成分的凝血酶抑制剂的分子模拟

摘要

以中药党参有效成分为研究对象,使用ADME特性筛选,分子对接和分子动力学方法,研究了与凝血酶的抑制作用.结果表明,筛选出的灌木远志酮A和川芎哚具有较好的对接结果.通过分子动力学方法分别获取了灌木远志酮A和川芎哚与凝血酶结合的稳定结构.两种化合物分别与凝血酶的残基形成了疏水作用和强度不同的氢键,这些基团之间的相互作用是化合物可能具有相应活性的关键因素.川芎哚的抑制能力强于灌木远志酮A,形成氢键的数目及氢键存活率是其稳定性的主要原因.结果可为发现高效的直接凝血酶抑制剂,以及结构改良提供理论参考.