2015-2018年豫南地区猪圆环病毒2型分子流行病学调查

摘要

为了解豫南地区猪圆环病毒2型(PCV2)的流行情况及毒株的分子变异特征,采用PCR技术,对2015年—2018年豫南地区157份疑似PCV2感染的组织样品进行PCR检测,并对部分PCV2阳性样品进行了全基因组克隆测序和序列分析.结果显示,43份为PCV2阳性,阳性率为27.39％,对部分阳性样品进行克隆测序获得了13株全基因组序列.经序列比较和遗传进化树分析,结果发现,13株豫南株中有1株属于PCV2a,2株属于PCV2b,10株属于PCV2d,各个基因型中分离株与较早分离的参考毒株同源性较低,与近期分离的参考毒株同源性高.此外,通过对ORF2基因编码的氨基酸序列进行分析,发现各基因型Cap蛋白氨基酸序列上的变异位点基本都在Cap蛋白的抗原表位上并且各基因型都有其独特的变异位点.结果表明,PCV2在豫南地区感染较为普遍,PCV2 d已成为豫南地区的优势流行株,这为豫南地区猪PCVD的疫苗研发和防控提供了参考依据.