4株NDV分离株F基因的克隆与序列分析

摘要

对4株具有一定代表性的NDV(新城疫病毒)分离株的F基因进行RT-PCR(反转录-聚合酶链反应)扩增和序列分析,根据基因裂解位点的氨基酸序列推测,其中1株属于弱毒株,3株属于强毒株;核苷酸序列及其推导的氨基酸序列比较结果表明,3株强毒株与Clone30基因核苷酸序列的同源性在83.6%～84.0%之间,与F48E9典型NDV强毒株同源性在86.5.6%～88.3%之间,推导的氨基酸序列同源性与Clone-30株在 85.9%～87.0%之间,与F48E9典型NDV强毒株在89.1%～91.3%之间;利用MegAlign软件绘制了NDV的系统发育进化树,结果表明,3株分离强毒株为Ⅶ基因型,弱毒株为基因Ⅱ型.