Illumina MiSeq高通量测序分析不同品种桑树内生细菌多样性

摘要

为了分析不同抗病性桑树品种内生细菌多样性,利用基于Illumina MiSeq的高通量测序技术,从桑椹菌核病不同抗性品种(抗性品种:长果桑与川桑7637;易感品种:新伦教与红果2号)中共获得有效序列92282条,将高于97％ 相似度的划分为一个操作分类单元(O T U),优化后得到5858个OTUs.内生细菌种群分析结果表明,变形菌门(Proteobacteria,36.10％)、厚壁菌门(Firmicutes,14.51％)、酸杆菌门(Acidobacteria,13.38％)、拟杆菌门(Bacteroidetes,11.85％)以及放线菌门(Actinobacteria,6.35％)为各品种果桑的共有优势菌门,假单胞菌属(Pseudomonas,8.01％)为其共有优势菌属,但这些优势菌群在不同品种桑树中所占的比例均有差异.内生细菌多样性分析结果表明,抗性品种川桑7637的内生细菌多样性最高,长果桑次之,而易感品种新伦教与红果2号则相对较低.研究结果显示,桑树茎内具有丰富的内生细菌资源,抗性品种的内生细菌多样性高于易感品种.