基于高通量测序分析头颈肿瘤中CircRNAs的表达谱差异

摘要

目的 基于高通量测序分析头颈肿瘤(HNC)中环状RNA(CircRNAs)的表达谱差异,探究其临床应用价值.方法 通过高通量测序、基因本体和KEGG通路分析检测18例HNC患者的肿瘤组织及癌旁组织中CircRNAs的表达及其功能.采用实时荧光定量PCR验证部分CircRNAs在137例HNC组织及癌旁组织中的差异表达,结合临床资料和ROC曲线分析其应用价值.结果 在18例HNC肿瘤组织和癌旁组织中共有714个CircRNAs差异表达,涉及的主要功能和通路与肿瘤相关.hsa_circ_0012212和hsa_circ_0016148在137例HNC组织的表达水平均低于癌旁组织(均P＜0.05).结合临床资料分析发现hsa_circ_0012212与年龄相关,hsa_circ_0016148与头颈肿瘤分类和淋巴结转移相关(均P＜0.05).ROC曲线分析表明hsa_circ_0012212和hsa_circ_0016148对HNC的诊断具有潜在价值.结论 hsa_circ_0012212和hsa_circ_0016148有望成为HNC诊断的分子标志物.