肿瘤抗原SCCAg B细胞抗原表位及HLA Ⅰ类限制性CTL表位的生物信息学分析

摘要

目的 预测鳞状细胞癌抗原(squamous cell carcinoma antigen,SCCAg)的B细胞抗原表位及HLA Ⅰ类限制性细胞毒性T细胞表位.方法 获得SCCAg的三维结构后,采用生物信息学方法预测SCCAg蛋白存在的B细胞表位;而后,采用NetCTL、ProtParam等软件方法预测SCCAg中可能存在的HLA Ⅰ类限制性CTL表位.结果 SCCAg蛋白中包含10个线性B细胞表位和5个构象B细胞表位;结合与HLA Ⅰ类分子结合力、蛋白酶体切割效率和TAP转运效率,经NetCTL预测发现,针对不同的HLA I类分子,肿瘤抗原SCCAg蛋白中存在多个HLA Ⅰ类分子的限制性CTL表位.结论 综合运用多种方法预测了肿瘤抗原SCCAg蛋白中存在的B细胞抗原表位和HLA Ⅰ限制性的CTL表位,为下一步针对SCCAg蛋白开展靶向免疫治疗提供了基础.