基于生物信息学检测NSUN2基因在胶质瘤中的表达及临床意义

摘要

目的探究NSUN2基因在多形性胶质瘤(GBM)中的表达及临床意义。方法从TCGA数据库下载正常脑组织和GBM组织测序数据及临床信息,采用R语言分析NSUN2基因的表达差异及其与临床病理特征的关系,利用单因素和多因素Cox回归模型分析GBM发生发展相关风险因素,CSEA软件分析NSUN2基因可能参与的信号通路,实时荧光定量PCR(qPCR)和免疫组织化学(IHC)对胶质瘤组织和癌旁组织进行mRNA和蛋白质表达水平验证分析。结果 GBM组织中NSUN2表达高于正常组织,差异有统计学意义(P<0.05);不同年龄、WHO分级、应答深度及IDH分型的GBM组织中NSUN2表达比较,差异有统计学意义(P<0.05);单因素和多因素Cox回归分析显示,NSUN2基因可作为GBM的独立预后因素。CSEA结果显示,NSUN2高表达与肿瘤相关通路相关;qPCR和IHC实验显示,与癌旁组织相比,胶质瘤组织中NSUN2基因的m RNA和蛋白质表达水平更高,差异有统计学意义(P<0.05)。结论 GBM组织中NSUN2基因高表达且和病理特征相关,可能通过参与蛋白质相关的代谢促进GBM的发展,可作为GBM的预后标志物。