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基于生物信息学数据库探讨FOXO3基因在膀胱癌中的表达及临床意义

     

摘要

目的:探讨叉头转录蛋白O亚族3(FOXO3)基因在膀胱癌中的表达及临床意义.方法:利用GEPIA数据库分析FOXO3基因在膀胱癌与其癌旁正常组织中的表达情况,及其与患者预后的关系,利用UALCAN数据库分析膀胱癌中FOXO3表达与淋巴结转移的关系;通过TIMER数据库分析FOXO3基因表达与膀胱癌免疫浸润水平的相关性;通过String数据库分析与FOXO3相互作用的蛋白.结果:GEPIA数据库分析结果显示,FOXO3基因在膀胱癌组织中的表达显著低于癌旁正常组织(P<0.01);低表达FOXO3基因的患者总生存率(OS)和无疾病生存率(DFS)均显著高于高表达者(P<0.05).UALCAN数据库分析结果显示膀胱癌中FOXO3的表达与淋巴结转移无明显相关.TIMER数据库分析显示FOXO3基因表达与B细胞(r=0.133,P<0.05)、CD8+T细胞(r=0.262,P<0.01)、CD4+T细胞(r=0.12,P<0.05)、巨噬细胞(r=0.252,P<0.01)、中性粒细胞(r=0.242,P<0.01)和树突状细胞(r=0.162,P<0.01)的免疫浸润水平呈正相关.蛋白相互作用网络分析发现,AKT1、SIRT1、EP300、BCL2L11、SOD2、SGK1、AKT2、CREBBP、CDKN1B、SMAD4等蛋白与FOXO3具有明显相互作用.结论:基于肿瘤基因数据库分析发现,FOXO3基因在膀胱癌组织中低表达,其高表达与患者预后不良相关;FOXO3表达与膀胱癌免疫细胞的浸润水平有关.

著录项

  • 来源
    《癌变·畸变·突变》|2020年第5期|374-379|共6页
  • 作者单位

    兰州大学第二医院 甘肃省泌尿系统疾病研究重点实验室/甘肃省泌尿系临床医学中心 甘肃 兰州 730030;

    兰州大学第二医院 甘肃省泌尿系统疾病研究重点实验室/甘肃省泌尿系临床医学中心 甘肃 兰州 730030;

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    兰州大学第二医院 甘肃省泌尿系统疾病研究重点实验室/甘肃省泌尿系临床医学中心 甘肃 兰州 730030;

    兰州大学第二医院 甘肃省泌尿系统疾病研究重点实验室/甘肃省泌尿系临床医学中心 甘肃 兰州 730030;

    兰州大学第二医院 甘肃省泌尿系统疾病研究重点实验室/甘肃省泌尿系临床医学中心 甘肃 兰州 730030;

  • 原文格式 PDF
  • 正文语种 chi
  • 中图分类 膀胱肿瘤;
  • 关键词

    膀胱癌; FOXO3; 数据库; 表达; 诊断;

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