高丛蓝莓类黄酮3'-羟化酶基因F3'H的克隆及表达特性分析

摘要

以高丛蓝莓(Highbush blueberry)“喜来(Sierra)”和“日出(Sunrise)”为研究材料,通过RACE (rapid amplification of cDNA end,RACE)技术获得蓝莓(Vaccinium ssp.) F3'H基因的全长cDNA序列,并使用生物信息学工具对该基因编码蛋白的氨基酸组成及理化性质、二级和三级结构,以及氨基酸序列的相似性等进行了预测和分析.利用荧光定量PCR (RT-qPCR)手段来检测其在蓝莓果实不同发育时期表达情况.结果表明:VsF3'H全长cDNA为1 871 bp,编码530个氨基酸,蛋白相对分子质量为58.33 kD,理论pI值为7.32;蛋白疏水性指数为0.004,属于疏水性蛋白,二三级结构预测可知其富合α-螺旋和无规则卷曲.RT-qPCR发现VsF3'H主要在果实发育前期表达量较高,蓝果期表达量明显下调,且在不同品种中以蓝果期的表达量差异显著.这些研究结果为解析蓝莓果实色泽发育及果树分子育种奠定了理论基础.