变性高效液相色谱法筛选鼻咽癌相关基因单核苷酸多态性

摘要

目的利用变性高效液相色谱法(DHPLC)结合测序筛选和鉴定鼻咽癌基因的单核苷酸多态性(SNPs).方法PCR扩增30例鼻咽癌患者和28例正常对照者6p213区域基因PPP1R11、PP1R10、FLOT1、KIAA0170的4个外显子与1个内含子片断,采用DHPLC技术对扩增片断进行基因变异检测,将不同的类型PCR片断进行全序列测定并与参考序列对照分析.结果在5个片断中初步鉴定出4个未见报道的新SNP位点,验证了4个已知的SNPs位点和基因型.结论DHPLC预测结合全序列测序是一种高效、经济、简便、可靠的SNP筛选方法.