基于高通量测序分析花生不同器官内生细菌群落多样性

摘要

通过Illumina MiSeq高通量测序技术,对花生根、茎、叶、花不同器官内生细菌16S rRNA的V5～V7可变区进行测序,研究花生内生细菌群落多样性.从花生不同器官内一共获得61396条有效序列和468个OTU(Operational Taxonomic Units).物种分类显示花生内生细菌种类隶属于21个门、43个纲、107个目、177个科和284个属.根部内生细菌优势属为假单胞菌属(Pseudomonas)、慢生根瘤菌属(Bra-dyrhizobium)和魏斯氏菌属(Weissella),相对丰度分别为37.67％、25.13％和7.38％;茎部内生细菌优势属为假单胞菌属(Pseudomonas)和红球菌属(Rhodococcus),相对丰度分别为73.12％和8.88％;叶部内生细菌优势属为假单胞菌属(Pseudomonas)和红球菌属(Rhodococcus),相对丰度分别为78.65％和8.55％;花部内生细菌优势属为假单胞菌属(Pseudomonas),相对丰度为15.15％.PICRUSt功能预测表明,叶部内生细菌中参与调控各种代谢通路的物种丰度最高,茎部和根部次之,花部最低.以上研究结果表明花生内生细菌具有丰富的种群多样性,为今后开发利用花生内生细菌资源奠定了基础.