秦川牛Chemerin基因第2和第6外显子的SNPs检测及其与肉质性状的相关性

摘要

[目的]对秦川牛Chemerin基因第2和第6外显子进行SNPs检测,并研究其与秦川牛肉质性状的相关性.[方法]采用DNA直接测序技术并结合PCR-SSCP方法,对324头2～3岁秦川牛Chemerin基因第2和第6外显子进行多态性分析,用最小二乘法拟合线性模型对Chemerin基因不同基因型与秦川牛肉质性状(宰前活质量、胴体质量、背膘厚、大理石花纹评分、系水力、眼肌面积和嫩度)进行关联分析.[结果]秦川牛Chemerin基因第2外显子868 bp处发生了A→G突变,第6外显子2 948 bp处发生了C→G突变;用PCR-SSCP方法检测得到AA、AG、GG、EE和EF 5种基因型,其基因型频率分别为0.219 1,0.432 1,0.348 8,0.348 4和0.651 6,均处于中度多态,其中C2948G位点处于Hardy-Weinberg极度不平衡状态(P＜0.01).关联分析结果表明,秦川牛Chemerin基因第2外显子AA基因型与眼肌面积、背膘厚、大理石花纹评分和系水力均显著相关(P＜0.05);第6外显子各基因型与供试肉质性状间没有相关性(P＞0.05).[结论]Chemerin基因第2外显子可能是影响秦川牛眼肌面积、系水力和大理石花纹评分等肉质性状的主效QTL或与之紧密连锁,可以尝试将其用作秦川牛品质改良的辅助选择标记.