PCR-SSCP

摘要： 【目的】分析马可·波罗盘羊MHC-DRB3基因第2外显子多态性,确定其等位基因数及核苷酸、氨基酸多态位点,以及与家养绵羊的遗传进化关系。【方法】采用PCR-SSCP方法对39只马可·波罗盘羊、159只塔什库尔干羊、72只藏绵羊、76只宁夏滩羊、36只柯尔克孜羊和26只多浪羊MHC-DRB3基因第2外显子的等位基因进行检测,对不同绵羊品种产生的差异等位基因进行克隆及测序,并对等位基因单倍型序列进行分析;利用生物信息学在线软件分析马可·波罗盘羊MHC-DRB3基因第2外显子编码蛋白的理化性质、结构和功能。【结果】试验共获得66个MHC-DRB3等位基因,马可·波罗盘羊、塔什库尔干羊、藏绵羊、宁夏滩羊、柯尔克孜羊和多浪羊的等位基因数分别为23、14、12、12、4和1个。马可·波罗盘羊、塔什库尔干羊、藏绵羊、宁夏滩羊和柯尔克孜羊MHC-DRB3基因第2外显子等位基因序列中的核苷酸多态位点分别为74、76、45、49和25个,表明相较于藏绵羊、宁夏滩羊和柯尔克孜羊,马可·波罗盘羊和塔什库尔干羊的多态性更高。系统发育分析表明,马可·波罗盘羊和塔什库尔干羊MHC-DRB3基因均呈两支分化;马可·波罗盘羊、塔什库尔干羊和藏绵羊MHC-DRB3基因单倍型的相似性较高。马可·波罗盘羊MHC-DRB3基因第2外显子编码产物为不稳定亲水性蛋白,二级结构主要以无规则卷曲和α-螺旋为主,其生物学作用主要在细胞质中体现。【结论】本试验确定了马可·波罗盘羊和5种家养绵羊MHC-DRB3基因第2外显子的等位基因数及核苷酸、氨基酸多态位点,为进一步探究绵羊MHC-DRB3基因的调控机理及进化意义提供材料。

摘要： 晋中绵羊是山西优良的地方品种,是蒙古羊与山西晋中当地品种杂交形成的产肉性能较好的农区粗毛短脂尾地方品种,具有生长快、易肥育、肉质鲜嫩的特点,1年1胎,双胎率低.大量学者开展了晋中绵羊的营养与饲料、遗传与繁殖、毛绒品质和羊肉加工方向的研究,本文将晋中绵羊的相关文献进行归纳、整理和分析,阐述各位学者开展晋中绵羊的营养与饲料、遗传和繁殖等方向的研究工作进展,进而为晋中绵羊的未来发展提供参考.

摘要： 为鉴定子午岭黑山羊KRTAP36-1基因,并分析其与羊绒性状的相关性,以绵羊KRTAP36-1基因编码区序列为模板,利用GenBank的BLAST功能,在山羊染色体上进行同源性搜索,用聚合酶链反应-单链构象多态性(Polymerase chain reaction-single strand conformation polymorphism,PCR-SSCP)和测序方法,检测342只子午岭黑山羊上的核苷酸序列变异,最后用一般线性混合效应模型分析序列变异与羊绒性状的相关性.结果表明,在342只子午岭黑山羊上检测到3条不同的核苷酸序列(命名为A、B和C),进化树发现这3条序列与绵羊KRTAP36-1序列有最高的同源性,表明这些序列来自于山羊KRTAP36-1基因.测定结果表明,山羊KRTAP36-1基因有2个SNPs,其中一个(c.119A/G)为错义突变,导致p.Tyr40Cys的氨基酸改变.相关性分析表明,KRTAP36-1核苷酸序列A的存在与子午岭黑山羊较小的产绒量相关(P0.05).综上,KRTAP36-1基因可以作为子午岭黑山羊羊绒性状的分子标记,用于提高该群体的产绒量.

摘要： 试验旨在探讨哈萨克羊诱导型一氧化氮合酶(iNOS)基因多态性与布鲁氏菌病的相关性.使用虎红平板凝集试验(RBPT)方法对231只哈萨克羊血清进行布鲁氏菌病血清学检测,参考GenBank中绵羊iNOS基因序列,针对其第6、7、8外显子及其邻近内含子片段设计引物,利用PCR-SSCP技术和DNA测序技术对231只哈萨克羊的iNOS基因进行多态性检测,分析其SNPs与哈萨克羊布鲁氏菌病易感性的相关性.结果表明,67只哈萨克羊为布鲁氏菌感染阳性,阳性检出率为29.00％.在哈萨克羊iNOS基因的外显子6和8片段上未检测到多态位点,在外显子7片段上检测出F7-T18054C和F7-C18084T 2个多态位点,在F7-T18054C多态位点上检测到3种基因型(TC、TT、CC),优势等位基因和基因型分别是C型和CT型,其等位基因频率和基因型频率分别是0.660和0.446.在F7-C18084T多态位点上检测到2种基因型(CT、CC),优势等位基因频率和基因型分别是C和CC型,其等位基因和基因型频率分别是0.946和0.892.F7-C18084T属于低度多态(P IC0.05).试验结果表明,哈萨克羊iNOS基因F7-T18054C和F7-C18084T多态位点与布鲁氏菌病易感性不存在相关性.

摘要： [目的]探究哈萨克羊诱导型一氧化氮合酶基因(iNOS)多态性与布鲁菌易感性的关系.[方法]使用虎红平板凝集试验(RBPT)进行哈萨克羊布鲁菌病血清学检测.参考GenBank中绵羊iNOS基因序列,针对其2,4,5外显子及其邻近内含子片段(exon 2/intron,exon 4/intron and exon 5/intron)设计引物,采用PCR-SSCP和DNA测序技术对231只哈萨克羊的iNOS基因进行多态性检测,分析其单核苷酸多态性(SNPs)与布鲁菌易感性之间的关系.[结果]经检测发现67只哈萨克羊为布鲁菌感染阳性,阳性检出率为29.00％.在哈萨克羊iNOS基因的exon 2/intron片段上检测出F2-C1910T多态位点,检测到CC、CT 2种基因型,优势等位基因和基因型分别是C和CC,其频率分别是0.924和0.848.在exon 4/intron片段上检测出F4-T11519C和F4-A11546G两个多态位点,其中F4-T11519C位点有2个等位基因T、C,有TT、CC、TC 3种基因型,优势等位基因和基因型分别是T和TC,其频率分别是0.714和0.528;F4-A11546G位点有2个等位基因A、G,有AA、AG、GG 3种基因型,优势等位基因和基因型分别是A和AG,其频率分别是0.714和0.528.在exon 5/intron片段上检测出F5-C12707T位点,有2个等位基因C、T,有CC、TT、CT 3种基因型,优势等位基因和基因型分别是C和CT,其频率分别是0.600和0.506.F2-C1910T位点为低度多态性位点,F4-T11519C、F4-A11546G和F5-C12707T位点为中度多态性位点.x2检验表明,哈萨克羊iNOS基因F2-C1910T和F5-C12707T位点与布鲁菌易感性的相关性不显著(P＞0.05),F4-T11519C和F4-A11546G位点与布鲁菌易感性的相关性极显著(P＜0.01).哈萨克羊iNOS基因F2-C1910T位点的易感基因型为CC,F4-T11519C位点的易感基因型为TT、TC,F4-A11519G位点的易感基因型为AA、AG,F5-C12707T位点的易感基因型为CC、CT.[结论]哈萨克羊iNOS基因F2-C1910T和F5-C12707T位点与布鲁菌易感性无相关性,F4-T11519C和F4-A11546G位点与布鲁菌易感性存在相关性.

摘要： 本研究采用聚合酶链式反应-单链构象多态性(PCR-SSCP)分析方法检测3个绵羊的促黄体素受体(LHR)基因第11外显子的多态性.结果表明,促黄体素受体(LHR)外显子11在小尾寒羊、大尾寒羊和豫西脂尾羊中存在3种基因型,记为AA、BB和AB.小尾寒羊、大尾寒羊和豫西脂尾羊的AA、BB和AB基因型频率分别为:0.045、0、0.174;0.659、0.902、0.565;0.295、0.098、0.261.测序结果发现,不同基因型之间有5个位点发生突变,其中在37位发生G、A突变;在49位发生T、C突变;在93位发生T、C突变;在139位发生T、G突变;在184位发生A、G突变.

摘要： 试验旨在检测牦牛乳铁蛋白(lactoferrin,LF)基因多态性,评估基因突变对牦牛乳品质性状的影响,以期丰富牦牛重要经济性状的分子遗传研究.应用PCR-SSCP方法,检测甘南牦牛、西藏牦牛和天祝白牦牛LF基因5'UTR和内含子4突变,结合甘南牦牛乳品质测定,评估基因突变对其乳品质性状的影响.结果表明,牦牛LF基因5'UTR检测到c.-568 G＞A的突变,等位基因A1和基因型A1B1频率最高,为优势等位基因和基因型;内含子4检测到c.499+56 C＞A突变,基因型A2B2频率最高,为优势基因型,等位基因A2为甘南牦牛和天祝白牦牛优势等位基因,而B2为西藏牦牛优势等位基因;各类群牦牛检测区域多态信息含量(PIC)介于0.25～0.50,属中度多态.关联分析表明,甘南牦牛LF基因突变影响部分胎次甘南牦牛乳品质性状,其中5'UTR第2胎基因型A1A1和A1B1个体无脂固体物质百分含量显著高于B1B1个体(P＜0.05);内含子4第3胎基因型A2B2和B2B2个体乳脂率显著高于A2A2型个体(P＜0.05),第4胎基因型B2B2个体的乳脂率显著低于A2A2和A2B2型个体(P＜0.05).以上结果表明,甘南牦牛、西藏牦牛和天祝白牦牛LF基因存在多态性,甘南牦牛LF基因5'UTR、内含子4突变分别影响无脂固体物质含量和乳脂率,可以作为潜在的分子遗传标记.

摘要： 应用低温胁迫试验及PCR-SSCP技术对罗非鱼TCP-1-eta基因多态性进行检测,并采用最小二乘法分析TCP-1-eta基因多态性与罗非鱼耐寒性状之间的相关性.结果 表明:根据TCP-1-eta基因序列设计的TCP1-1、TCP1-2、TCP1-3和TCP1-4引物中,TCP1-4引物在最终恒定温度为8、12、14°C样本中的电泳图呈现带型多态性,其中在12、14°C时基因多态性与耐寒性状的相关性显著(P<0.05).因此推测出TCP-1-eta基因是罗非鱼潜在的耐寒基因.

摘要： 本研究应用PCR-SSCP技术分析了贵州黑白花奶牛leptin基因启动子区的多态性与产奶性能的相关性，为贵州黑白花奶牛的标记辅助选育提供理论支持。

摘要： 本研究应用PCR-SSCP技术分析了贵州黑白花奶牛leptin基因启动子区的多态性与产奶性能的相关性，为贵州黑白花奶牛的标记辅助选育提供理论支持。

摘要： 本研究应用PCR-SSCP技术分析了贵州黑白花奶牛leptin基因启动子区的多态性与产奶性能的相关性，为贵州黑白花奶牛的标记辅助选育提供理论支持。

摘要： 本研究应用PCR-SSCP技术分析了贵州黑白花奶牛leptin基因启动子区的多态性与产奶性能的相关性，为贵州黑白花奶牛的标记辅助选育提供理论支持。

摘要： 本研究以草原红牛、西门塔尔牛、利木赞牛及天一冈山黑牛共263头为研究对象。利用PCR-SSCP结合测序的方法分析肉质性状候选基因CAPN3的多态性，从分子水平上分析牛的遗传特征。为寻找与生产性状相关的分子标记提供理论依据。

摘要： 本研究以草原红牛、西门塔尔牛、利木赞牛及天一冈山黑牛共263头为研究对象。利用PCR-SSCP结合测序的方法分析肉质性状候选基因CAPN3的多态性，从分子水平上分析牛的遗传特征。为寻找与生产性状相关的分子标记提供理论依据。

摘要： 本研究以草原红牛、西门塔尔牛、利木赞牛及天一冈山黑牛共263头为研究对象。利用PCR-SSCP结合测序的方法分析肉质性状候选基因CAPN3的多态性，从分子水平上分析牛的遗传特征。为寻找与生产性状相关的分子标记提供理论依据。

摘要： 本研究以草原红牛、西门塔尔牛、利木赞牛及天一冈山黑牛共263头为研究对象。利用PCR-SSCP结合测序的方法分析肉质性状候选基因CAPN3的多态性，从分子水平上分析牛的遗传特征。为寻找与生产性状相关的分子标记提供理论依据。

摘要： 本研究以草原红牛、西门塔尔牛、利木赞牛及天一冈山黑牛共263头为研究对象。利用PCR-SSCP结合测序的方法分析肉质性状候选基因CAPN3的多态性，从分子水平上分析牛的遗传特征。为寻找与生产性状相关的分子标记提供理论依据。

摘要： 本研究以草原红牛、西门塔尔牛、利木赞牛及天一冈山黑牛共263头为研究对象。利用PCR-SSCP结合测序的方法分析肉质性状候选基因CAPN3的多态性，从分子水平上分析牛的遗传特征。为寻找与生产性状相关的分子标记提供理论依据。