细粒棘球蚴RTN4基因的克隆及序列分析

摘要

[目的]克隆细粒棘球蚴(Eg)内质网膜蛋白4 (Reticulon-4,RTN4)抗原基因,对其序列进行生物信息学分析.[方法]采集感染Eg的绵羊肝脏和肺脏,提取Eg头节总RNA为模板,对RTN4基因进行RT-PCR扩增,将PCR产物克隆到pMD19-T载体后测序,对其核苷酸序列及氨基酸序列进行生物信息学分析.[结果]Eg RTN4 cD-NA全长654 bp,编码217个氨基酸,蛋白质分子质量为25.3 ku,等电点为8.83.编码氨基酸序列中含有1个N端酰基化位点、2个酪蛋白激酶Ⅱ磷酸化位点和4个蛋白激酶C磷酸化位点.经生物信息学软件预测,RTN4蛋白的抗原表位区主要集中在第1-47位、第71-147位和第171-217位区域;含有2个高度疏水区,2个跨膜区,膜外区分别位于第1-47位和第171-217位.[结论]成功克隆了Eg R TN4基因,预测了其编码蛋白抗原的结构和表位.