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紫草LePS-2基因启动子的克隆及序列分析

         

摘要

目的 克隆紫草LePS-2基因的启动子,分析该启动子的调控元件,为研究LePS-2基因的表达调控机制奠定基础.方法 以紫草愈伤组织基因组DNA为模板,利用Genome walking技术扩增LePS-2基因上游启动子序列,将序列提交至PLACE网站对该启动子进行调控元件预测.结果 获得LePS-2基因启动子区域序列1164bp,PLACE软件分析表明,该启动子中存在根特异性元件、暗诱导性元件、激素应答与调节相关元件以及一些转录因子结合位点等.结论 启动子元件ATATT和YTCANTYY可能分别赋予LePS-2表达的根特异性和暗诱导性;另外在LePS-2基因启动区域还发现MJ应答元件TGACG,表明MJ有可能参与对LePS-2的表达调控.%OBJKCTIVE To clone the promoter of LePS-2 gene of Lithospermum erythrorhizon, and to analyze its mechanism of the expression regulation. METHODS 1164 bp of LePS-2 promoter fragment was amplified from Lithospermum callus genomic DNA by using Genome Walking method, which was then submitted to the PLACE website for regulatory element predict. RESULTS 1164bp of LePS-2 promoter fragment was obtained; and several important cis-acting elements, including root organ-specific elements, dark-induced elements, regulatory elements for hormones as well as some transcription factor binding sites were recognized by PLACE program. CONCLUSION Motif-AT ATT and motif-YTCANTYY may respectively confer root-specific expression and dark-induced pattern of LePS-2. Furthermore, a MJ response element "TGACG" was found in the promoter region, which shows that MJ may participate in regulating LePS-2 gene expression.

著录项

  • 来源
    《南京中医药大学学报》 |2012年第3期|245-248|共4页
  • 作者单位

    南京大学生命科学学院医药生物技术国家重点实验室,南京大学-南京林业大学植物分子生物学联合研究所,江苏南京210093;

    南京大学生命科学学院医药生物技术国家重点实验室,南京大学-南京林业大学植物分子生物学联合研究所,江苏南京210093;

    南京大学生命科学学院医药生物技术国家重点实验室,南京大学-南京林业大学植物分子生物学联合研究所,江苏南京210093;

    南京大学生命科学学院医药生物技术国家重点实验室,南京大学-南京林业大学植物分子生物学联合研究所,江苏南京210093;

    南京大学生命科学学院医药生物技术国家重点实验室,南京大学-南京林业大学植物分子生物学联合研究所,江苏南京210093;

  • 原文格式 PDF
  • 正文语种 chi
  • 中图分类 转化及克隆;
  • 关键词

    紫草; LePS-2; 启动子; 染色体步移; 调控元件;

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