猪NTF3基因启动子的克隆及序列分析

摘要

[目的]分析猪NTF3基因的启动子结构,初步探索其功能及转录调控机制.[方法]根据NCBI网址已公布的猪NTF3基因5′侧翼序列,设计特异引物进行PCR扩增、克隆测序及序列比对,获得猪NTF3基因启动子序列,并利用在线软件对其进行生物信息学分析.[结果]成功克隆得到了猪NTF3基因5′端上游约1724 bp的片段,GC含量约为52.5％;预测了其核心活性区域,发现在5′端-439 bp和-750 bp处存在2个潜在的转录起始位点,同时发现了1个TATA-box、1个CAAT-box、2个GC-box和3个GT-box,但未发现CpG岛;该序列还包含GATA-1、GATA-2、SRY、Sp1、C/EBPβ、AmL-1a、YY1、MZF1和NF-kappaB等转录因子结合位点.[结论]运用生物信息学方法分析了猪NTF3基因启动子的序列与结构,可为进一步揭示NTF3基因对公猪繁殖性能的调控机制提供理论依据.