胃癌lncRNAs在血液和组织池谱差异表达研究

摘要

目的:探讨lncRNAs在胃癌(gastric cancer,GC)患者血液和组织池谱内的差异表达及相关性,探究潜在的血液生物标记物的起源.方法:研究对象为20例初治GC患者和20例无癌对照者.采用lncRNAs基因芯片检测lncRNAs在原发肿瘤和邻近的健康黏膜中的差异表达.用高通量TaqMan OpenArray检测肿瘤患者和健康人群外周血浆中差异表达的lncRNAs,并与肿瘤门静脉引流血浆进行对比分析.结果:原发肿瘤和相邻黏膜之间差异表达的lncRNAs有108个(87上调和21下调).TaqMan OpenArray分析鉴定的434个ln-cRNAs中,显示22个lncRNAs在胃癌患者与健康对照组血清相差2倍以上,经过RT-PCR验证,最终只有11个lncRNAs的表达在校正后仍旧有意义,其变化倍数从4到23倍不等.经过进一步分析,组织和血液均异常共表达的lncRNAs只有4个,分别为:LINC00693、RP11-462L8.1、RP4-622L5.7、SYN2.最后,我们将对从外周和胃网膜静脉获得的配对血浆样品进行对比,只有2个之前在外周血中检测异常表达的lncRNAs在门静脉中也是显著增加的,这2个基因为SYN2和LINC00693.结论:胃癌患者血浆和组织中差异表达的lncRNAs具有显著不同,提示大多数潜在的血液lncRNAs生物标志物可能并非直接起源于肿瘤组织.