胃癌转移相关长链非编码RNA差异表达谱的研究

摘要

目的筛选与胃癌转移相关的长链非编码RNA(lncRNA),寻找可预测及逆转胃癌转移相关的候选基因。方法利用高通量lnc RNA芯片技术分别检测3例未发生远处转移胃癌组织和3例发生远处转移胃癌组织中lncRNA及mRNA表达谱的差异,并对差异表达基因进行基因本体论(GO)和京都基因与基因组百科全书(KEGG)分析。结果远处转移胃癌组与无远处转移组相比,有549个lncRNAs及386个mRNAs差异性表达具有统计学意义,其中远处转移胃癌组织中表达升高的lncRNAs共230个,表达升高的mRNAs共208个,表达下降的lncRNAs共319个,表达下降的mRNAs共178个。GO分析显示差异性表达基因的功能主要涉及到肿瘤细胞的生长、代谢、浸润、免疫调节等多种生物过程。KEGG分析显示差异性表达基因的通路主要涉及到细胞因子及其受体相互作用、趋化因子、细胞代谢等信号通路。结论筛选出了胃癌侵袭转移相关的lncRNAs,深入分析这些差异表达lncRNAs的功能及机制可为胃癌侵袭转移寻找出特异性肿瘤标志物及有效治疗靶点。