2015—2016年中国部分地区PBoV检测及遗传进化分析

摘要

为了调查2015—2016年中国部分地区猪博卡病毒流行情况,在我国各地中抽取了89份猪样本,用PCR方法对这些样本进行检测,并对其中有扩增阳性的产物进行基因序列检测,将测序结果进行对比分析,找出其中可能存在的同源性或遗传性证据.在89份检测样本中,检测出PBoV的样本42分,占比47.19％,其中山东地区的样本阳性率最低,上海、江西地区阳性率最高.NS1基因序列分析结果显示,鉴定的5株PBoV均属于PBoV 3型,且这5株PBoV的核苷酸同源性达到了80.0％～85.6％,因此,可以预测其氨基酸的同源性在82.9％至87.9％之间.将这5株进行遗传进化分析,结果显示:检测的MH822023、MH822025、MH822024、MH82022、MH82026毒株与参考KC473563、KF025390、KF025379、KF025389、KF025380毒株具有较高同源性.