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传染性法氏囊病病毒河北分离株(HB-bp)基因组A节段全长cDNA的克隆和序列分析

     

摘要

采用RT-PCR技术,以传染性法氏囊病病毒河北分离株(HB-bp)基因组RNA为模板,扩增并克隆了IBDV HB-bp株基因组A节段全长cDNA.结果表明:克隆的A节段全长共3 142个核苷酸,包括5′、3′端非编码区(NCRs)和2个部分重叠的开放阅读框(ORF1和ORF2),与其它血清Ⅰ型毒株相比,HB-bp株在核苷酸水平上有32~146个核苷酸的差异,同源性为95.4%~98.8%;在氨基酸水平上有5~35个氨基酸的替代,同源性为96.9%~99.5%,与血清Ⅱ型毒株同源性为89.8%~90.8%.与其他超强毒株的同源性最高,具有超强毒株的特征性氨基酸,因此HB-bp株为中国的一个超强毒株.

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