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桃基因组中R类抗病基因同源序列的克隆与序列分析

     

摘要

许多抗病基因均具有核苷酸结合位点(NBS)和富含亮氨酸重复区(LRR).根据已知的NBS-LRR型抗病基因蛋白质的保守序列,设计简并引物,用以扩增桃基因组中的抗病基因同源序列.获得一条大小约500 bp的扩增片段,克隆测序后得到4个NBS-LRR类抗病基因同源片段(PNBS1、PNBS2、PNBS3、PNBS4).推导的氨基酸均具有P-loop(激酶1a)保守区和中间的激酶2a、激酶3a保守区,除PNBS4外,均具有3端疏水结构域.它们与已克隆的N、L6、PRS2等抗病基因在核苷酸水平上的同源性为21.1%~58.8%;在氨基酸水平上的同源性为18.8%~41.4%.这些抗病基因同源片段(RGA)可做为分子标记筛选桃的抗病候选基因.

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