蒙古冰草基因组类反转录转座子基因同源序列的克隆与序列分析

摘要

以蒙古冰草DNA为模板,采用PCR扩增的方法从蒙古冰草(Agropyron mongolicum Keng)中分离得到了一个类反转录转座子基因序列,命名为MwRRT(GenBank:GQ855806.1).序列分析结果表明:该序列长为1 005 bp,包含780 bp的开放阅读框,编码260个氨基酸.经GenBank中BLAST程序分析表明,该片段98～255处氨基酸与水稻(Oryza sativa)预测逆转录转座子蛋白Ty3-gypsy亚类、预测种属特异抗原-聚合酶(Gag-P01)前体和预测聚合酶氨基酸同源性为47%;与高粱(Sorghum bicolor)的预测GAG-POL前体氮基酸同源性为52%.