年龄有关的差异甲基化且差异表达基因的特点

摘要

当前DNA甲基化和基因表达之间的复杂关系还没有一个明确结论,年龄上差异甲基化基因的特点有待进一步研究.在年龄间距大的匹配的DNA甲基化和表达的数据上,基于区域分析方法识别年龄上差异甲基化区域,提取差异甲基化且差异表达基因,并集成多种数据鉴别它们的特点.分析结果表明,差异甲基化区域的变化模式在基因坐标区域内具有很高的一致性;Gene Body是DNA甲基化的重要调控区域,大部分差异甲基化区域分布于此区域,高甲基化区域和低甲基化区域分别更易于出现在CGI promoter基因和nonCGI promoter基因;在差异甲基化区域与基因表达水平的关系上,非差异表达/上调/下调的差异甲基化区域都同时存在正关联、负关联和无关联,在上述的复杂关系中,非差异表达的DMR偏向正相关,反之差异表达的DMR偏向负相关;对正关联和负关联的差异甲基化且差异表达基因利用蛋白质互作网络信息进行分类,同时对这两类基因进行GO富集性分析,结果显示,正关联和负关联的差异甲基化且差异表达基因与蛋白质互作的不同功能模块有关联性,提示两类基因很可能关联于不同的表达调控模式.