基于一种新的伪氨酸组成预测蛋白质折叠速率

摘要

以chou等人提出的伪氨酸组成方法为基础,从蛋白质序列的氨基酸组成信息和顺序信息着手,提出一种新的伪氨酸组成方法,即利用新伪氨酸序列的自相关函数、氨基酸的平均中程接触和氨基酸频率构造了23维向量来描述蛋白质序列,进而建立多元线性回归函数对蛋白质折叠速率进行预测,经jackknife检验相关系数达到了0.84.并与其他两种方法进行比较使本文的结论得到较好的验证.同时验证了本文提取的特征参数对蛋白质折叠速率有一定的影响.