8个地理种群红条毛肤石鳖COI基因的遗传多样性分析

摘要

[目的]分析我国8个沿海潮间带红条毛肤石鳖地理种群的COI基因的遗传多样性.[方法]利用聚合酶链式反应(PCR)技术扩增8个地区80个红条毛肤石鳖样品的COI基因.使用DNASP5.10.01、MEGA7.0等软件对所得序列进行分析,得到片段碱基含量、遗传距离以及遗传多样性参数等数据,并通过构建系统发育树的方式,结合遗传多样性数据分析结果.[结果]获得的COI基因片段长度为659 bp,COI基因位于线粒体编码区中,平均A、T、C、G的碱基含量分别20.4％、41.7％、14.9％和23.0％,存在明显的AT偏向,结合Acan-thochitona crinita为外群系统发育树的结果来看,中国沿海地区红条毛肤石鳖种群分成2个明显的聚群,将它们定义为北方群体和南方群体,遗传距离为0.00066～0.08785.单倍型遗传多样性数据显示,多样性数值较高,但核苷酸多样性较低.[结论]红条毛肤石鳖北方群体的遗传多样性与南方群体存在差异,2个群体应该分别采取相应措施来保护遗传多样性.