小麦AB基因组中一个重复序列的分离、定位与应用

摘要

利用102对微卫星引物对5份黑麦(Secale)、4份普通小麦(Triticum aestivum)和1份分枝小黑麦(Triticalc)进行SSR分析,引物Xgwm614能在分枝小黑麦中扩增出一个387 bp的特异DNA片段(记为FZ387,GenBank登录号为EF179137),而黑麦未能扩增出.序列比对结果显示该片段与一粒小麦(T. monococcum)(AY485644)和栽培二粒小麦(T.turgidum)(AY494981)A基因组中Gypsy Ty3-LTR反转座子fatima的一部分分别有94%和95%同源性.根据序列同源性比对结果,在FZ387内部设计1对特异引物FaF和FaR.引物Xgwm614F和FaR能在含有A基因组的物种中扩增出约350 bp的条带(记为A350),而其不含A基因组的物种都未扩增出该条带.利用小麦二体和端体代换系材料对其进行定位,结果显示该片段分布在所有A染色体的长臂和短臂上.此外,引物FaF和Xgwm614R能在含有A、S或AB基因组的物种中扩增出约350bp的条带(记为AB350),而不含AB基因组的材料未扩增出目标条带.利用这两对特异引物对小麦属近缘物种进行PCR扩增,发现只有中国春能够扩增出A350和AB350.序列比对结果和FZ387两侧SSR引物结合区的变化表明,该反转座子类似序列在进化上可能存在基因组间多样性和相似性.A350和AB350也可以分别作为分子标记检测A和AB染色体组.