花生黑腐病菌碳水化合水解酶的全基因组分析

摘要

花生黑腐病(Cylindrocladium black rot of peanut,简称CBR)是由寄生帚梗柱孢霉(Cylindrocladium parasiticum Crous,Wingfield&Alfenas)侵染引起的一种严重的检疫性病害,给农业生产造成了巨大的经济损失。以笔者所在实验室前期获得的花生黑腐病菌全基因组18366个蛋白序列为基础,利用CAZymes Analysis Toolkit预测程序进行注释,共获得注释碳水化合水解酶(CAZymes)1197个,分为6个家族,分别为191个辅助酶(auxiliary activities,简称AAs)、137个糖基转移酶(glycosyl transferases,简称GTs)、422个糖苷水解酶(glycoside hydrolases,简称GHs)、48个多糖裂解酶(polysaccharide lyases,简称PLs)、300个碳水化合物酯酶(carbohydrate esterases,简称Ces)、99个碳水化合物绑定结构(carbohydrate-binding modules,简称CBMs)。根据Blast2GO对花生黑腐病菌CAZymes蛋白的功能分析结果,将CAZymes分为3大类分别为生物进程、细胞成分、分子功能类。该研究可为进一步解析CAZymes的功能奠定基础,为深入研究该致病菌侵染植物的作用机制提供了一定的理论依据。