全基因组预测希金斯炭疽菌中碳水化合物酶类蛋白

摘要

希金斯炭疽菌侵染菜心等十字花科植物引起的炭疽病,给各国农业生产造成了巨大的经济损失.基于前期研究结果,以658个分泌蛋白为基础序列,利用CAZymes Analysis Toolkit预测程序,分析上述蛋白中的碳水化合物酶类(CAZymes)蛋白,明确该菌中含有238个CAZymes,分为主要类别和复合类别2类,前者包括75个糖苷水解酶(GHs)、48个碳水化合物绑定结构(CBMs)、33个辅助酶类家族(AAs)、30个碳水化合物酯酶(CEs)、23个多糖裂解酶(PLs)、4个糖基转移酶(GTs),后者则包括17个GHs/CBMs、4个AAs/CBMs、4个CEs/CBMs等.研究结果可为深入开展该病菌侵染植物作用机制的研究提供一定的理论基础.