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猪肉嫩度相关QTL整合定位与基因关联分析研究

         

摘要

为了优化猪肉嫩度相关数量性状位点(quantitative trait loci,QTL),为基因的精细定位和克隆奠定基础,通过Meta分析,利用数学模型整合猪肉嫩度相关QTL,分析已知候选基因与MQTL的关联性。收集猪肉嫩度相关QTL,将其逐一映射到美国肉畜研究中心(USDA-MARC2.0)公布的猪遗传连锁图谱,构建整合图谱。进行Meta分析,得到精确性更高的MQTL,并将已知候选基因映射到整合图谱,比较候选基因与各MQTL的关联性。研究表明:99个猪肉嫩度相关QTL映射到参考图谱,构建成新的整合图谱。通过Meta分析,定位了16个MQTL,图距2.42~25.18cM,29.21%~93.18%。值得一提的是MQTL1和MQTL2,图距仅为2.42cM和3.22cM,且分别由9个和20个原始QTL聚合而成,有较高的研究价值。将FABP3、MYPN和ANK1基因映射到整合图谱,分别定位在MQTL5、MQTL12和MQTL16区间内,距离中心位置5.70cM、3.67cM和2.49cM,可将这些区间作为关键区域,开展基因精细定位和挖掘工作。

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