一种鉴定与黄瓜嫩果皮色相关的QTL及基因的方法

摘要

本发明公开的一种鉴定与黄瓜嫩果皮色相关的QTL及基因的方法，包括：(1)母本和父本杂交获得F1，构建重组自交系RILs；(2)各株系嫩果皮颜色的鉴定和数据统计分析；(3)提取各RIL株系及其亲本基因组DNA；(4)将亲本、RIL株系基因组DNA进行全基因组重测序，并进行SNP变异检测和基因分型分析；(5)确定每个表型的LOD值阈值及其对应的QTL区段；(6)将QTL区段内的SNP检测结果比对到黄瓜参考基因组，查找相关基因，进行基因功能注释。本发明的优点在于，该方法采用高通量测序方法对自创的高代RILs进行基因型鉴定，获得传统方法不能企及的分子标记数和高密度连锁图谱，为高效准确鉴定黄瓜嫩果皮色相关基因提供支撑。