猪肉pH值相关QTL整合定位与基因关联分析

摘要

为了整合与优化猪肉pH值相关数量性状位点(quantitative traitloci,QTL),为分子标记辅助选择奠定基础,采用Meta分析,整合猪pH相关QTL,并对已知候选基因与"真实"QTL(MQTL)进行关联。收集猪肉pH值相关QTL,将其映射到美国肉畜研究中心(USDA-MARC2.0)公布的猪遗传连锁图谱,构建新的整合图谱,新图谱中的QTL簇经Meta分析,聚合为MQTL。进一步将已知候选基因映射到整合图谱,比较候选基因与各"真实"QTL的位置差异,分析其关联性。结果显示:224个原始QTL聚合成37个QTL簇,通过Meta分析,得到37个MQTL。MQTL的95%置信区间1.35～25.32cM,相比原始QTL缩短29.20%～92.36%。其中,MQTL35、MQTL16、MQTL10、MQTL4和MQTL17的置信区间均在5cM以内,且分别是由7、8、4、5、7个QTL聚合而成,具有较高的精确度和一致性。LYZ、RYR1、VTN、MYPN和PRKAG3基因映射到整合图谱后,分别定位在MQTL13、MQTL18、MQTL29、MQTL32和MQTL34置信区间内,可将其作为关键区域,开展深入研究工作。