北京基因组所开发长非编码RNA数据库LncBook

摘要

近日,由中国科学院北京基因组研究所开发的人类长非编码RNA(long non-coding RNA,lncRNA)数据库LncBook正式上线。该项研究成果以“LncBook a curated knowledgebase of human long non-coding RNAs”为题在国际学术期刊《核酸研究》(Nucleic Acids Research)在线发表。近年来,有关lncRNA的研究一直是国际热点,研究表明,lncRNA在多种生物过程中发挥了重要作用并与疾病的发生密切相关,但lncRNA的注释信息及质量仍远远落后于蛋白编码基因。LncBook数据库不仅提供了丰富的高质量人类lncRNA数据集,还进行了大规模的多组学数据分析,以及系统的功能与疾病注释,为功能实验研究及生物信息学分析提供了大量可用信息与数据。LncBook数据库中的相关信息均可免费下载。LncBook作为重要的lncRNA资源库,提供了目前为止数据量最为丰富的人类lncRNA数据。作为LncRNAWiki数据库的补充,LncBook具备友好的查询、浏览与可视化功能。用户可通过ID/symbol、功能、疾病名称等检索lncRNA信息,浏览指定lncRNA的多组学信息,并通过ftp下载所有相关注释信息与分析结果。此外,LncBook还提供了可用于lncRNA序列比对、分类、编码能力预测等研究的工具,方便在线分析。