核苷酸序列比对在生物系统发育研究中的应用

摘要

作为确定分子数据初级同源性(primary homology)的过程,比对的重要性在于后续算法的选择.本文对其在生物系统发育研究中的作用及其基本步骤与算法做了简要说明;从理论与实践相结合的角度介绍了使用最为广泛的软件,讨论了其中的空位(gap)问题、参数问题和比对结果校正等问题;并且对此领域中前沿的基因组比对研究进展做了概述.