引起两起手足口病聚集性疫情的柯萨奇病毒A6的VP1基因特征及其分子流行病学研究

摘要

目的了解两起疫情的Cox A6的VP1基因特征的异同,研究其分子流行病学特征。方法测定其VP1基因全序列,用分析软件对VP1基因做适应性进化分析。结果从两起聚集性疫情中分离到的Cox A6分别属于2013年流行的2个流行亚群,其中1个亚群在氨基酸254位发生R→K的突变,该突变被推测是受正向选择作用的结果。而且两起聚集性病例的分枝分化时间分别是在2012年第3季度-第4季度和2012年第4季度-2013年第1季度。结论在本地区2013年流行的手足口肠道病毒Cox A6的2个主要的流行亚群的分化时间在2010年冬季-2011年春季,经过2年～3年的低流行期后目前在本地区进入高流行期,并在本市分别引起了两起手足口病聚集性疫情。