2013-2014年手足口病患者柯萨奇病毒A10型宁夏分离株VP1区基因特征分析

摘要

目的：了解宁夏手足口病(hand,foot and mouth disease,HFMD)病例中柯萨奇病毒A10型(Coxsackievirus A10,CVA10)分离株的基因特征.rn 方法：收集2013-2014年宁夏各市县非EV71和CVA16的肠道病毒核酸检测阳性标本,使用RD细胞进行病毒分离,获得的毒株用兼并引物进行VP1区基因扩增和序列测定.测序结果利用BLAST进行病毒型别鉴定后,对鉴定为CVA10的所有毒株进行基因特征分析.rn 结果：两年共收集到非EV71和CVA16的肠道病毒标本450份,分离到CAV1036株,其中2013年6株,2014年30株.36株CVA10分布于宁夏各个地区,各毒株株间的核苷酸和氨基酸同源性分别为90.6％-100.0％和87.3％-100.0％.与A、B、C、D各型别代表株的同源性比较发现,36株毒株与C型代表株的核苷酸和氨基酸同源性最高,分别为90.2％％-98.9％和95.7％-99.7％.系统发生树显示,36株CVA10宁夏株与C基因型代表株处于同一分支.rn 结论：CVA10是引起青海省HFMD的常见病原体,本次分离到的CVA10均属于C基因型,具有较宽的同源性范围.