基于焦磷酸测序技术建立基因编辑水稻检测方法

摘要

基因编辑技术发展迅速,但对应的检测方法较少.为寻找创建基因编辑作物适用的检测方法,以PL3基因编辑水稻编辑位点为靶标,有效设计了焦磷酸测序的扩增引物及测序引物,并进行有效性检测,分别利用Sequence to Analyze等程序以及SNP和AQ两种模式完成了对PL3基因的定性和定量检测试验,建立了PL3基因编辑水稻编辑位点焦磷酸测序检测方法.结果表明,基于焦磷酸测序技术可以通过检测编辑位点从而将基因编辑型水稻与野生型水稻进行区分.与常规的转基因检测方法相比,该检测方法具有较好的准确性、高效性及高灵敏度等优点,在基因编辑型水稻编辑位点定性和定量检测分析方面具有很好的应用前景.