基于元胞自动机图的2019-nCoV溯源研究

摘要

病毒溯源是研究病毒人际传播规律和演化历史,发现病毒的传播机理,并寻找病毒源头是控制疫情的核心科研攻关环节。本文采用元胞自动机将病毒的基因组数据转换为图像,使用Canny边缘检测方法生成特征图像,采用SSIM值评估病毒序列特征图像的相似性,基于病毒序列图像相似性的聚类热图和A-T含量曲线,发现蝙蝠冠状病毒RaTG13和穿山甲冠状病毒在各个指标中都与2019-nCoV更为接近,进而推测出2019-nCoV可能来自蝙蝠,穿山甲可能是该病毒的中间宿主。