基于高通量测序考察甘肃黄芪种植区根际土壤微生物群落结构及多样性

摘要

采用高通量测序技术,考察分析甘肃6个不同黄芪种植区黄芪根际微生物菌群结构特征。结果表明,甘肃黄芪种植的六个地区其根际土壤细菌分属于31个门、97个纲、211个目、330个科、614个属、共1163个种,根际土壤真菌分属于13个门、46个纲、98个目、202个科、412个属、共656个种。细菌在门水平的群落结构特征主要为放线菌门(Actinobacteriota)和变形菌门(Proteobacteria),其中宕昌县采集的样本中以变形菌门为优势菌群,其余地区为放线菌门。真菌在门水平的群落结构主要为子囊菌门(Ascomycota)、担子菌门(Basidiomycota)和被孢霉门(Mortierellomycota),六个种植地区优势真菌均为子囊菌门(Ascomycota),相对丰度均在75%以上。6个黄芪种植区中,基于种水平的微生物群落进行主坐标分析,宕昌黄芪种植区的根际土壤细菌群落结构和渭源县种植区根际土壤真菌群落结构组成不同于其它地区。