基于MATLAB的基因芯片图像预处理

摘要

目的:基手MATLAB设计低密度基因芯片图像预处理系统,对经过Stan Array扫描系统获得的用cy3和cy5染色的低密度芯片的荧光图像进行处理,以滤除噪声,增强图像的对比度,提高图像的质量,实现图像的边缘检测与分割,进行区域的识别.方法:采用小波中值滤波方法,滤除噪声,提高图像的质量;基于小渡方法,结合边缘算子进行图像边缘检测:使用遗传算法实现图像的分割.结果:该系统对基因芯片图像进行处理,减少了污点、噪声及其他各种因素的影响,提高了图像的质量,可以更好地检测出图像的边缘,比较准确地分割出样点区域,能有效地分离有价值的弱信号点和背景点或者噪声.结论:该系统可以基本实现低密度基因芯片图像预处理功能.采用的图像处理方法是可行的,能为以后的分析提供较为准确的数据信息.