化脓链球菌金属结合蛋白Dpr的相互作用蛋白筛选

摘要

目的 Dpr蛋白是与细菌毒力密切相关的铁离子结合蛋白,从Dpr蛋白潜在的相互作用蛋白网络出发,通过生物信息学手段分析这些蛋白发挥的功能以及参与的生物过程,揭示Dpr蛋白在化脓链球菌(Streptococcus pyogenes)中发挥作用的新机制.方法 表达和纯化融合蛋白(GST-Dpr);通过GST-Pull down和质谱联用的方式,筛选化脓链球菌中与Dpr蛋白相互作用的蛋白.结果 三次独立重复实验共同鉴定到26个相互作用蛋白;基于String分析构建各蛋白间的相互作用网络发现,这些相互作用蛋白中有15个蛋白与Dpr存在直接或间接的联系;利用生物信息学手段分析这些相互作用蛋白的分子功能以及可能参与的生物学途径,发现它们大多能够结合金属离子,主要参与碳代谢、丙酮酸代谢、糖代谢以及糖异生等生物过程.结论 Dpr蛋白可能通过与本研究中鉴定的GAPDH、AccD、Eno、RpsB和Fus等蛋白相互作用来共同完成相关的生物学功能.通过建立的Dpr蛋白相互作用蛋白网络,为全面阐述Dpr蛋白在细菌定植和毒力方面的功能提供了重要的理论基础和新思路.