传染性支气管炎CK/CH/HD/190716株的分离鉴定与全基因组分析

摘要

对河北某免疫鸡场采集疑似感染传染性支气管炎病毒(IBV)鸡的肺脏进行病毒分离,并通过鸡胚接种和全基因序列测定分析,对分离病毒进行鉴定和遗传变异分析.分离到1株IBV,命名为CK/CH/HD/190716,该病毒接种鸡胚后可产生IBV特征性的侏儒胚.该病毒基因组总长为27 680 bp,其中Ploy A尾含有16个A.将分离株基因序列与不同基因型的IBV毒株进行同源比对,构建遗传进化树进行基因分型,证实该毒株属于QX型.选取我国分离的14株QX型IBV与之比较同源性,发现该型病毒全基因组的同源性在93％ ～97％,但是5a基因的同源性最低,只有80％,表明IBV各基因之间的进化具有显著差异.随后通过多个重组软件分析证实,该毒株的1a基因部分区域由QX型野毒KX425847和KU317090重组产生.本试验揭示了我国流行的QX型IBV存在基因多样性,需要对该型病毒的遗传演化进行密切监测.