贵州省PCV2流行株的分型及遗传变异分析

摘要

为了解贵州省猪圆环病毒2型(PCV2)的分子流行病学及遗传变异情况,本文收集2012 ～ 2016年间16株贵州PCV2流行毒株和NCBI上报道登录的35株PCV2序列作生物信息学分析.分析结果显示,在本次所分析的各PCV2毒株之间核苷酸变异率较大的分别为ORF6(32.22％)、ORF10 (29.63％)、ORF2 (24.11％)、ORF5(21.60％)、ORF7(20.00％);遗传进化表明,贵州省16株PCV2序列中3株为PCV2a型,5株为PCV2b型,8株为PCV2d型;其中PCV2d型已经逐渐过渡成为贵州省的主要流行毒株,且同种基因型之间ORF2所编码的氨基酸序列保守性相对较高.表明PCV2流行毒株之间由于基因型的不同,可能会导致免疫力或致病力的改变.该结果以期为贵州省PCV2的防控、流行病学的研究提供一定的参考.