2017-2019年上海市松江区诺如病毒感染性腹泻疫情的病毒基因型特征分析

摘要

目的 了解2017-2019年上海市松江区诺如病毒感染性腹泻疫情病毒基因型特征.方法 收集上海市松江区2017-2019年69起由诺如病毒引起的感染性腹泻疫情的流行病学资料及相关样本,用针对诺如病毒ORF1和ORF2连接区进行基因测序的方法进行诺如病毒基因测序及型别鉴定.结果 2017-2019年,上海市松江区共报告诺如病毒感染腹泻疫情69起,共检测1767份样本:619份病例样本(诺如病毒阳性率19.9％),343份从业人员样本(诺如病毒阳性率1.1％),505份环境样本(诺如病毒阳性率0.5％)和300份食品样本(未检出).测序获得141株基因序列,基因型别分析显示2017年和2018年主要引起感染性腹泻的基因型别为GⅡ.P16-GⅡ.2(50.98％,26/51),而2019年引起感染性腹泻的基因型别中GⅡ.P16-GⅡ.2(13.73％,7/51)和GⅡ.Pe-GⅡ.4(9.80％,5/51)较多.结论 引起上海市松江区2017-2019年诺如病毒感染的69起腹泻疫情病毒主要的基因型别为GⅡ.P16-GⅡ.2,呈明显的春、秋冬季高峰,且幼儿园及学校的事件较多.