用AFLP技术分析四川核桃资源的遗传多样性

摘要

利用AFLP分子标记技术,运用EcoR Ⅰ/Mse Ⅰ双酶切组合,选用多态性高、分辨力强的4对选择性扩增引物组合E32/M48、E33/M61、E35/M61、E33/M62分别对四川省3个野生核桃(Juglans regia)种群和1个野生铁核桃(J.sigillata)种群共46个样品进行遗传多样性分析、居群遗传结构分析及种属关系探讨.结果表明:1)共扩增出244个遗传位点,其中146个多态位点,多态率为59.84%;核桃群体组和铁核桃群体的多态性百分率分别为55.33%和52.05%,两个物种遗传多态性水平相当;核桃群体组所检出的位点平均有效等位基因数Ae、Nei's基因多样度H、平均Shannon信息指数玢别为1.322 9、0.190 8和0.286 3,而铁核桃群体分别为1.339 9、0.196 1和0.289 8,铁核桃群体遗传多样性水平略高于核桃群体.2)群体间特异带及群体间共有带占总扩增带数的15.16%,其中铁核桃群体特异谱带最多,群体特异谱带揭示了群体间的遗传差异及相似性.3)Shannon信息指数(I)、Nei's基因多样性指数(H)和分子方差分析(AMOVA)表明核桃遗传多样性在群体间和群体内的分布分别为14.36%和85.64%、12.6%和87.4%、11.07%和88.93%,表明群体内的遗传多样性大于群体间的遗传多样性;核桃群体组与铁核桃群体的变异主要存在于群体组内,组间的遗传变异仅占总变异的9.35%,两者间的遗传分化系数Gst为0.093 5,与AMOVA分析结果一致.4)4个群体的Nei's遗传距离在0.038 2～0.069 22.间,遗传一致度在0.933 2～0.962 5之间,表现出较高的遗传相似性;运用Nei's遗传一致度对供试种群进行了UPGMA聚类,结果表明核桃的3个群体优先聚类,大渡河流域群体与甘南地区群体聚类最近.AFLP所检测出的结果既是核桃与铁核桃生物学特性的反映,又是其各自生态学特性的反映,该研究结果对核桃种质资源的保护和育种提供一定的理论依据.