基于网络药理学和分子对接技术探讨中药复方防治新型冠状病毒肺炎的作用机制

摘要

目的运用网络药理学和分子对接技术探讨中药复方防治新型冠状病毒肺炎(COVID-19)的作用机制。方法通过中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)及SwissTargetPrediction数据库获取中药复方的活性成分及靶点,在GenCLiP 3和GeneCards数据库筛选新型冠状病毒肺炎疾病靶点,与中药复方活性成分靶点取交集,构建中药-活性成分-靶点网络。通过STRING数据库及Cytoscape3.7.1软件构建蛋白相互作用(PPI)网络,通过DAVID进行GO功能与KEGG通路富集分析。采用AutoDock Vina对中药活性成分及COVID-19疾病靶点进行分子对接初步验证。结果从中药复方中筛选出163个活性成分,作用于952个靶点,其中与COVID-19相关靶点264个,获得9味药、150个活性成分和264个靶点的中药-活性成分-靶点网络。度值>15.05的关键作用靶点共72个,富集分析得到生物过程、细胞组成和分子功能共108个及20条相关通路。PPI网络显示AKT1、EGFR、HSP90AA1、PTGS2、MTOR、MAPK14、ERBB2、PIK3CA、EP300和PIK3R1起关键作用。分子对接显示,中药复方活性成分与3CL水解酶、ACE2-SARS-CoV-2 S蛋白对接打分和关键靶点的结合亲和力较好。结论中药复方的活性成分能作用于AKT1、EGFR、HSP90AA1、PTGS2、MTOR、3CL水解酶和ACE2-SARS-CoV-2 S蛋白等靶点,调节多条信号通路,发挥抗炎和免疫调节等作用,进而起到对COVID-19的防治作用。