柯萨奇B5病毒所致无菌性脑膜炎暴发的病原学鉴定及基因特征分析

摘要

目的对2009年山东省临沂市一起无菌性脑膜炎暴发所分离的病原体进行鉴定,并分析其基因特征。方法采集无菌性脑膜炎患者脑脊液标本42份,分离病毒;RT-PCR扩增阳性分离物,测定VP1核苷酸序列,与GenBank中其他毒株进行同源性分析,并构建VP1基因亲缘进化树。结果分离到肠道病毒17株,经肠道病毒组合血清中和试验和分子分型鉴定为柯萨奇B5病毒（CVB5）。CVB5分离株之间核苷酸和氨基酸同源性分别为92.3%～100.0%和98.7%～100.0%,与CVB5原型株（FauIkner株）的核苷酸和氨基酸的同源性分别为81.0%～82.4%和96.6%～97.0%。VP1区亲缘进化树分析显示,全球CVB5可分为A、B、C、D共4个基因型,引起本次无菌性脑膜炎暴发的CVB5属于基因型D,但位于不同的传播链中。结论 CVB5是此次临沂市无菌性脑膜炎暴发的病原体,分离株之间有较大的遗传差异,但均属于D基因型。